Technicien supérieur de laboratoire - H/F - #44817

L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.

L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.

Le Poste

Contrat de vacation de 2 mois non renouvelable

Structure Délégation Régionale Inserm Nouvelle-Aquitaine - Unité 1092 dirigée par Madame Marie-Cécile PLOY

A propos de la structure

L’ UMR 1092 "Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques » : RESINFIT existe depuis 2012. La thématique de recherche est la résistance aux anti-microbiens, antibiotiques et antiviraux avec un dimension One Health.

Mission principale

Notre laboratoire s’intéresse à la résistance bactérienne et notre modèle de travail est l’intégron de résistance aux antibiotiques. Les intégrons de résistance (IR) sont des éléments génétiques capables de capturer et exprimer des gènes de résistance contenus dans des « cassettes de gène ». Les IR sont fortement associés aux bactéries multi-résistantes. L’expression des cassettes de gènes dépend d’un promoteur Pc dont il existe plusieurs variants de force variable. Le Pc dit « faible » serait le variant à partir duquel les autres variants auraient évolué. Nous réalisons une expérience d’évolution dirigée en condition de culture planctonique et biofilm, en absence ou présence de concentrations sub-inhibitrices d’antibiotiques afin de déterminer si le mode de vie bactérien ou le stress antibiotique peut influencer le trajet évolutif. Les populations évoluées seront ensuite analysées par séquençage NGS long read et caractérisées phénotypiquement.

Les missions principales du candidat seront de finaliser la caractérisation génomique et phénotypique des populations évoluées et de clones isolés de ces populations.

Activités principales

• Analyses de données de séquençage NGS
• Mise en forme des résultats sous forme de figures, tableaux
• Cultures bactériennes en biofilm
• Détermination de CMI et CMIB
• Test adhésion et de formation de biofilm
• Courbe de croissance
  
  

Spécificité et environnement du poste

Vacation de 2 mois (période estivale)

Profil Recherché

Connaissances

Le, la candidat.e devra avoir des compétences en microbiologie, en expérience d’évolution dirigée, en analyse génomique bactérienne, de rédaction et de présentation des résultats

Le, la candidat.e devra avoir des connaissances solides en microbiologie (culture bactérienne, détermination de CMI, CMBI) et analyse génomique bactérienne (annotation, comparaison génomique)

Savoir-faire

Le, la candidat.e devra savoir mettre en œuvre des cultures bactériennes en planctonique et biofilm ; Savoir déterminer la CMI et la CMBI d’un antibiotique; Savoir utiliser Galaxy pour l’analyse des génomes.

Aptitudes

• Autonomie et esprit d'initiative
• Rigueur
• Organisation
• Dynamisme et curiosité
• Capacité à travailler en équipe